Berkaitan dengan visi STTII Yogyakarta yang adalah “Menjadi lembaga pendidikan teologi injili yang memiliki komitmen penuh kepada pelaksanaan Amanat Agung, yaitu pemberitaan Injil kepada segala bangsa sehingga pada tahun 2025 menjadi model penelitian teologi bagi sekolah-sekolah tinggi teologi Injili di Indonesia.”

Oleh sebab itu para dosen dan mahasiswa STTII Yogyakarta diberikan tugas penelitian yang dipublikasikan baik melalui jurnal internal lembaga STTII Predica Verbum maupun jurnal mahasiswa Sarjana Teologi PISTIS.